Dynamiques spatio-temporelles du zooplancton, en lien avec l'habitat et les petits poissons pélagiques, dans le Golfe de Gascogne.

Une diminution significative de la condition des petits poissons pélagiques (PPP) dans le Golfe de Gascogne (GdG) est observée depuis une vingtaine d années. Le zooplancton est la ressource trophique principale des PPP. Cette thèse explore l hypothèse que les dynamiques de l habitat forcent les dyna...

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Détails bibliographiques
Auteurs principaux : Grandrémy Nina (Auteur), Petitgas Pierre (Directeur de thèse), Dupuy Marie-Christine (Directeur de thèse), Romagnan Jean-Baptiste (Directeur de thèse), Barillé Laurent (Président du jury de soutenance), Lombard Fabien (Rapporteur de la thèse), Thiébaut Éric (Rapporteur de la thèse), Jamet Jean-Louis (Membre du jury), Pitois Sophie (Membre du jury), Garcia-Comas Carmen (Membre du jury)
Collectivités auteurs : Nantes Université 2022-.... (Organisme de soutenance), École doctorale Végétal, Animal, Aliment, Mer, Environnement Angers 2022-.... (Ecole doctorale associée à la thèse), Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (Laboratoire associé à la thèse)
Format : Thèse ou mémoire
Langue : français
Titre complet : Dynamiques spatio-temporelles du zooplancton, en lien avec l'habitat et les petits poissons pélagiques, dans le Golfe de Gascogne. / Nina Grandrémy; sous la direction de Pierre Petitgas et de Marie-Christine Dupuy et de Jean-Baptiste Romagnan
Publié : 2023
Accès en ligne : Accès Nantes Université
Note sur l'URL : Accès au texte intégral
Note de thèse : Thèse de doctorat : Environnement : Nantes Université : 2023
Sujets :
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314 |a Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Végétal, Animal, Aliment, Mer, Environnement (Angers ; 2022-....) 
314 |a Partenaire(s) de recherche : Ifremer -- Nantes (Laboratoire) 
314 |a Autre(s) contribution(s) : Laurent Barillé (Président du jury) ; Jean-Louis Jamet, Sophie Pitois, Carmen Garcia-Comas (Membre(s) du jury) ; Fabien Lombard, Éric Thiébaut (Rapporteur(s)) 
328 0 |b Thèse de doctorat  |c Environnement  |e Nantes Université  |d 2023 
330 |a Une diminution significative de la condition des petits poissons pélagiques (PPP) dans le Golfe de Gascogne (GdG) est observée depuis une vingtaine d années. Le zooplancton est la ressource trophique principale des PPP. Cette thèse explore l hypothèse que les dynamiques de l habitat forcent les dynamiques du zooplancton et que ces dernières se propagent jusqu aux PPP. Les données utilisées ont été créées à partir des échantillons de zooplancton pêchés dans le GdG au printemps lors des campagnes PELGAS de 2004 à 2019, et analysés avec deux outils d imagerie, le ZooScan et le ZooCAM, successivement. Un premier résultat de cette thèse montre l interopérabilité de ces deux instruments sur l intervalle de taille 0,3-3,39 mm. Nous avons construit une série temporelle de cartes du zooplancton de 16 ans, en combinant les jeux de données des deux instruments, et analysé cette série avec des méthodes factorielles multivariées afin d en caractériser les variations spatiales et temporelles. Notre résultat principal est que la biomasse du zooplancton et sa structuration spatiale à l échelle du plateau continental du GdG sont très stables dans le temps. Cette stabilité résulte d une compensation de l augmentation de l abondance par la diminution de la taille moyenne du zooplancton. Ces dynamiques du zooplancton sont expliquées par les dynamiques de l habitat (climat, hydrologie et PPP). En retour, les dynamiques du zooplancton amènent des éléments de compréhension des liens entre les différents compartiments de l écosystème pélagique, et de la diminution de la condition des PPP. Nous concluons sur l importance du zooplancton dans l analyse d écosystèmes pélagiques halieutiques. 
330 |a Small pelagic fish (SPF) body condition significantly decreased over the last 20 years in the Bay of Biscay (BoB). As zooplankton is the main SPF s food source, this thesis principal objective is to explore the hypothesis that habitats dynamics drive zooplankton dynamics, which in turn propagate to SPF (bottom-up hypothesis). The data used in this work were generated from zooplankton samples collected in spring, in the BoB, during the PELGAS ecosystemic cruises, from 2004 to 2019. The samples were analysed with two imaging instruments, namely the ZooScan and the ZooCAM, successively. We found that these two instruments are interoperable on the 0.3-3.39 mm zooplankton body size range. Combining the data originating from the two instruments, we constructed a 16 years time series of zooplankton descriptors maps. We then characterized the zooplankton spatio-temporal trends in the Bob using multivariate factorial methods. Our principal result is that zooplankton s spatial structuration and biomass are very stable over time at the scale of the BoB continental shelf. This stability results from a general decrease of zooplankton s body size compensated by an increase in small copepods abundance. These zooplankton dynamics are explained by its habitat dynamics especially the climate, hydrology and SPF dynamics. In turn, the observed zooplankton dynamics help unveil the complex links between the pelagic ecosystem components from climate drivers to small pelagic fish, and reinforce the bottom hypothesis to explain the SPF body condition decrease observed in the BoB over the last 20 years. We conclude on the importance of the zooplankton in the analysis of pelagic fisheries ecosystems. 
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