Nantilus
Régulation épigénétique et transcriptionnelle de KCNN1 et KCNA2 par la protéine de fusion EWS-FLI1 : rôle dans le contrôle de la prolifération des cellules de sarcome d 'Ewing
Le sarcome d'Ewing (SE) est la deuxième tumeur osseuse pédiatrique primitive maligne la plus fréquente. Le taux de survie des patients est d'environ 70 %, mais chute à 30 % pour les patients à hautrisque. Le traitement actuel consiste en une polychimiothérapie, suivie d'une résection...
Enregistré dans:
| Auteurs principaux : | , , , , , , |
|---|---|
| Collectivités auteurs : | , , |
| Format : | Thèse ou mémoire |
| Langue : | français |
| Titre complet : | Régulation épigénétique et transcriptionnelle de KCNN1 et KCNA2 par la protéine de fusion EWS-FLI1 : rôle dans le contrôle de la prolifération des cellules de sarcome d 'Ewing / Maryne Dupuy; sous la direction de Franck Verrecchia et de Françoise Redini |
| Publié : |
2023 |
| Note de thèse : | Thèse de doctorat : Biologie Cellulaire : Nantes Université : 2023 |
| Conditions d'accès : | Thèse confidentielle jusqu'au 06 juillet 2025. |
| Sujets : |
| Résumé : | Le sarcome d'Ewing (SE) est la deuxième tumeur osseuse pédiatrique primitive maligne la plus fréquente. Le taux de survie des patients est d'environ 70 %, mais chute à 30 % pour les patients à hautrisque. Le traitement actuel consiste en une polychimiothérapie, suivie d'une résection chirurgicale de la tumeur. Le SE se caractérise par une translocation chromosomique qui conduit, dans 85% des cas, à la formation de la protéine de fusion EWSFLI 1, et dans 1 O % des cas, par la protéine de fusion EWS-ERG, agissant toutes deux comme des oncogènes. Afin d'améliorer les traitements actuels et d'augmenter le taux de survie, notre objectif est de mieux comprendre la biologie du SE, en étudiant le rôle des canaux ioniques dans cette tumeur. En effet, des études ont émergé sur une expression anormale des canaux potassiques dans les cellules cancéreuses, où leurs fonctions ont été détournées pour favoriser le développement de la tumeur. Parmi ces canaux, sont retrouvés les canaux potassiques activés par le calcium et les canaux potassiques dépendants du voltage. Des analyses RNA-seq de 117 biopsies de patients et de 6 lignées de cellules de SE ont montré une forte expression de KCNN1, le gène codant pour SK1, et de KCNA2, le gène codant pour Kv1 .2. I" Nantes U Université L'objectif de ce projet de doctorat était d'étudier l'implication de ces canaux dans le développement des cellules de SE. Nous avons pu prouver que KCNN1 n'est fortement exprimé que dans les tissus et les lignées cellulaires de SE, les tissus sains exprimant à peine KCNN1, alors que KCNA2 est également fortement exprimé dans le gliome. Ensuite, l'analyse de données Ch IP-Seq a démontré la régulation de ces deux gènes par EWS-FLl1 et EWS-ERG, qui se lient aux microsatellites GGAA près de leurs promoteurs. De plus, en inhibant l'expression de KCNN1 ou KCNA2, nous avons montré l'implication de SK1 et Kv1 .2 dans la régulation de la prolifération des cellules de SE. Des expériences supplémentaires ont indiqué une dépolarisation de la membrane plasmique liée à l'inhibition de KCNN1, et une réduction significative des influx calciques dans les cellules n'exprimant pas KCNN1. En ce qui concerne KCNA2, il semble que son expression régule la voie Hippo, l'expression de YAP étant diminuée après l'inhibition de KCNA2. Dans l'ensemble, ces résultats soulignent que KCNN1 et KCNA2 sont des cibles directes de EWS-FLl1 et EWSERG, et qu'ils sont impliqués dans la régulation de la prolifération des cellules de SE, ce qui en fait des cibles thérapeutiques intéressantes dans le SE. Ewing's sarcoma (ES) is the second most common primary malignant pediatric bone tumor. The survival rate of patients is approximately 70%, but drops to 30% for high-risk patients. Current treatment consists of multidrug therapy followed by surgical resection of the tumor. OS is characterized by a chromosomal translocation that leads to the formation of the EWS-FLl1 fusion protein in 85% of cases and the EWS-ERG fusion protein in 10% of cases, both of which act as oncogenes. ln order to improve current treatments and increase survival rates, our goal is to better understand the biology of ES by studying the role of ion channels in this tumor. Indeed, studies have emerged on abnormal expression of potassium channels in cancer cells, where their functions have been hijacked to promote tumor development. Among these channels are calcium-activated potassium channels and voltage-dependent potassium channels. RNA-seq analyses of 117 patient biopsies and 6 ES cell lines showed high expression of KCNN1, the gene encoding SK1, and KCNA2, the gene encoding Kv1 .2. The objective of this PhD project was to study the involvement of these channels in SE cell development. We were able to prove that KCNN1 is highly expressed only in SE tissues and cell lines, healthy tissues hardly expressing KCNN1, while KCNA2 is also highly expressed in glioma. Next, ChlP-Seq data analysis demonstrated regulation of both genes by EWS-FLl1 and EWS-ERG, which bind to GGAA microsatellites near their promoters. Furthermore, by inhibiting the expression of KCNN1 or KCNA2, we showed the involvement of SK1 and Kv1 .2 in the regulation of EM cell proliferation. Additional experiments indicated plasma membrane depolarization related to KCNN1 inhibition, and a significant reduction of calcium influx in cells not expressing KCNN1. With respect to KCNA2, it appears that its expression regulates the Hippo pathway, with YAP expression being decreased after KCNA2 inhibition. Overall, these results highlight that KCNN1 and KCNA2 are direct targets of EWSFLl1 and EWS-ERG, and that they are involved in the regulation of ES cell proliferation, making them interesting therapeutic targets in ES. |
|---|---|
| Variantes de titre : | Epigenetic and transcriptional regulation of KCNN1 and KCNA2 by the EWS-FU 1 fusion protein : role in the control of Ewing sarcoma cell proliferation |
| Notes : | Titre provenant de l'écran-titre Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Nantes) Partenaire(s) de recherche : Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Intégrée Nantes Angers (Laboratoire), Chromatin and Transcriptional Deregulation in Pediatric Bone Sarcoma - CHILD (Laboratoire) Autre(s) contribution(s) : Olivier Delattre (Président du jury) ; Christophe Vandier (Membre(s) du jury) ; Valérie Coronas, Olivia Fromigué (Rapporteur(s)) |
| Configuration requise : | Configuration requise : un logiciel capable de lire un fichier au format : PDF |