Evaluation de l'efficacité de l'éradication d'Entérobactéries productrices de BLSE du tractus digestif murin et humain par phagothérapie

La résistance croissante des bactéries aux antibiotiques est un problème de santé publique mondial majeur. Le microbiote intestinal constitue un réservoir important de cette résistance. Cependant, peu de données sont disponibles sur la capacité de la phagothérapie à réduire le portage digestif de ba...

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Auteurs principaux : Javaudin François (Auteur), Montassier Emmanuel (Directeur de thèse), Batard Éric (Directeur de thèse), Ricard Jean-Damien (Président du jury de soutenance, Rapporteur de la thèse), Charpentier Sandrine (Rapporteur de la thèse)
Collectivités auteurs : Nantes Université 2022-.... (Organisme de soutenance), École doctorale Biologie-Santé Nantes (Ecole doctorale associée à la thèse), Cibles et Médicaments de l'Infection, de l'Immunité Nantes (Laboratoire associé à la thèse)
Format : Thèse ou mémoire
Langue : français
Titre complet : Evaluation de l'efficacité de l'éradication d'Entérobactéries productrices de BLSE du tractus digestif murin et humain par phagothérapie / François Javaudin; sous la direction de Emmanuel Montassier et de Éric Batard
Publié : 2022
Accès en ligne : Accès Nantes Université
Note sur l'URL : Accès au texte intégral
Note de thèse : Thèse de doctorat : Microbiologie : Nantes Université : 2022
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Description
Résumé : La résistance croissante des bactéries aux antibiotiques est un problème de santé publique mondial majeur. Le microbiote intestinal constitue un réservoir important de cette résistance. Cependant, peu de données sont disponibles sur la capacité de la phagothérapie à réduire le portage digestif de bactéries multirésistantes. Quatre nouveaux phages ont été isolés in vitro pour leur efficacité contre une souche d'E. coli productrice de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) associé à une carbapénémase OXA- 48. Nous avons développés plusieurs modèles murins de colonisation digestive à E. coli BLSE associant l'administration d'amoxicilline (0,5 g/L) et/ou de pantoprazole (0,1 g/L) dans l'eau de boisson. Quatre modèles de phagothérapie ont été testés contre placebo en mesurant la concentration fécale en E. coli BLSE. Pour un de ces modèles les phages étaient encapsulés. A part une légère diminution significative transitoire (-0.71 log CFU/g ; p=0,02) dans un des modèles, il n'a pas été mis en évidence de différence en concentration fécale d'E. coli BLSE avec la phagothérapie par rapport au placebo. L'efficacité des phages dans le tractus digestif est soumis à de nombreux obstacles : progression jusqu'à l'intestin, atteinte de leur cible et réussite de l'infection. D'autres connaissances sont encore nécessaires afin d'évaluer la capacité des phages à agir dans le tractus digestif et notamment en ce qui concerne les modèles de colonisation.
The growing resistance of bacteria to antibiotics is a major global public health concern. An important reservoir of this resistance is the gut microbiota. However, limited data are available on the ability of phage therapy to reduce the digestive carriage of multidrugresistant bacteria. Four novel phages were isolated in vitro for efficacy against an extended-spectrum betalactamase- producing (ESBL) E. coli strain associated with a carbapenemase OXA-48. We have developed several murine models of ESBL E. coli colonisation combining the administration of amoxicillin (0.5 g.L-1) and/or pantoprazole (0.1 g.L-1) in drinking water. Four phage therapy models were tested against placebo by measuring the faecal ESBL E. coli concentration. For one of these models the phages were encapsulated. Apart from a slight transient decrease (-0.71 log CFU.g-1; p=0.02) in one of the models, there was no difference in faecal ESBL E. coli concentration with phage therapy compared to placebo. The effectiveness of phages in the digestive tract is subject to many obstacles: progression to the intestine, reaching their target and successful infection. More knowledge is still needed to assess the ability of phages to act in the digestive tract, particularly with regard to colonisation models.
Variantes de titre : Evaluation of the efficacy of eradication of ESBL-producing Enterobacteriaceae from the murine and human digestive tract by phagotherapy
Notes : Titre provenant de l'écran-titre
Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Rennes)
Partenaire(s) de recherche : Cibles et Médicaments de l'Infection, de l'Immunité (Nantes) (Laboratoire)
Autre(s) contribution(s) : Jean-Damien Ricard (Président du jury) ; Jean-Damien Ricard, Sandrine Charpentier (Rapporteur(s))
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