Etude mathématique et numérique de modèles en chimiotaxie-fluide et applications à la biologie

Les résultats présentés dans ce mémoire sont dédiés à l étude théorique et numérique de modèles en chimiotaxie-fluide motivés par un large éventail de phénomènes biologiques comme la chimiotaxie de populations cellulaires dans un fluide. Les deux premiers chapitres portent sur la chimiotaxie dans un...

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Auteurs principaux : Chamoun Georges (Auteur), Saad Mazen Samir (Directeur de thèse, Membre du jury), Talhouk Raafat (Directeur de thèse, Membre du jury), Jauberteau François (Président du jury de soutenance, Membre du jury), Creusé Emmanuel (Rapporteur de la thèse, Membre du jury), Vohralík Martin (Rapporteur de la thèse, Membre du jury), Mourad Ayman (Membre du jury), Bendahmane Moustafa (Membre du jury)
Collectivités auteurs : Centrale Nantes 1991-.... (Organisme de soutenance), Laboratoire de Mathématiques Hadath, Liban (Organisme de cotutelle), École doctorale Sciences et technologies de l'information et mathématiques Nantes (Ecole doctorale associée à la thèse), Laboratoire de Mathématiques Jean Leray Nantes (Laboratoire associé à la thèse)
Format : Thèse ou mémoire
Langue : français
Titre complet : Etude mathématique et numérique de modèles en chimiotaxie-fluide et applications à la biologie / Georges Chamoun; sous la direction de Mazen Saad, Raafat Talhouk
Publié : 2014
Description matérielle : 1 vol. (XXX-146 p.)
Note de thèse : Thèse de doctorat : Mathématiques et leurs interactions : Ecole Centrale de Nantes : 2014
Thèse de doctorat : Mathématiques et leurs interactions : Université libanaise : 2014
Sujets :
Description
Résumé : Les résultats présentés dans ce mémoire sont dédiés à l étude théorique et numérique de modèles en chimiotaxie-fluide motivés par un large éventail de phénomènes biologiques comme la chimiotaxie de populations cellulaires dans un fluide. Les deux premiers chapitres portent sur la chimiotaxie dans un fluide au repos. Au début, on généralise un schéma de volumes finis au cas de modèles isotropes de Keller-Segel avec des coefficients diffusifs scalaires généraux sur des maillages admissibles. Ensuite, on propose et on étudie un schéma monotone combinant les méthodes de volumes finis et d éléments finis non conformes et permettant une discrétisation efficace et robuste de modèles de Keller-Segel avec des tenseurs diffusifs anisotropes hétérogènes sans imposer des conditions restrictives sur le maillage du domaine en espace. Les deux derniers chapitres sont dédiés à l étude théorique (existence globale, unicité) et l étude numérique (extension de la méthode combinée) du système chimiotactisme-fluide complet constitué d équations chimiotaxiques nisotropes couplées aux équations de Navier-Stokes modélisant un fluide incompressible. Ce couplage s effectue à travers les termes décrivant d un part le transport des cellules vivantes et du chimio-attractant par le fluide et d autre part la force gravitationnelle exercée par ces organismes vivants sur le fluide. Les travaux de cette thèse ont donné lieu à l écriture d un code de calcul très développé en Fortran 95 afin de valider nos résultats par des simulations numériques.
The results of this thesis are devoted to the theoretical and numerical study of chemotaxis-fluid models motivated by a wide range of biological phenomena such as the chemotaxis of cell populations in a fluid. The first two chapters deals with chemotaxis in a fluid at rest. In the beginning, we generalize a finite volume scheme to the isotropic Keller-Segel model with general scalar diffusive coefficients on admissible meshes. Then, we propose and we study a monotone combined finite volume-nonconforming finite element method allowing an efficient and robust discretization of Keller-Segel models with heterogeneous anisotropic diffusive tensors and without restrictions on the mesh of the space domain. The last two hapters are devoted to the theoretical and numerical study of a complete chemotaxis-fluid model consisting of anisotropic chemotaxis equations coupled to Navier-Stokes equations through transport of living cells and chemo-attractant by the fluid and through the gravitational force exerted by these living organisms on the fluid. The work of this thesis leads us to write a highly developed calculation code in Fortran 95 to validate our results by numerical simulations.
Variantes de titre : Mathematical and numerical analysis of chemataxis-fluid models and applications in biology
Notes : Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Sciences et technologies de l'information et mathématiques
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire de mathématiques Jean Leray
Autre(s) contribution(s) : François Jauberteau (président du jury) ; Emmanuel Creusé, Vohralik Martin (rapporteurs) ; Mazen Saad, Raafat Talhouk, Ayman Mourad, Moustafa Bendahmane (membres du jury)
Bibliographie : Bibliogr. p. 141-146