Étude des variants d'épissage dans le cadre des prédispositions aux cancers du sein et de l'ovaire : comparaison de deux méthodes préanalytiques pour l'étude de l'ARN messager

Le séquençage haut-débit a permis d'améliorer le diagnostic génétique des prédispositions génétiques aux cancers du sein et de l'ovaire. Cependant, il a aussi conduit à la détection d'une proportion importante de variants de signification inconnue. Parmi ces variants, les variants d&#...

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Auteurs principaux : Pierre-Noël Élise (Auteur), Bézieau Stéphane chercheur en génétique (Directeur de thèse), Denis Marc enseignant en biochimie (Président du jury de soutenance), Delnatte Capucine (Membre du jury), Classe Jean-Marc (Membre du jury)
Collectivités auteurs : Université de Nantes 1962-2021 (Organisme de soutenance), Nantes Université Pôle Santé UFR Médecine et Techniques Médicales Nantes (Organisme de soutenance)
Format : Thèse ou mémoire
Langue : français
Titre complet : Étude des variants d'épissage dans le cadre des prédispositions aux cancers du sein et de l'ovaire : comparaison de deux méthodes préanalytiques pour l'étude de l'ARN messager / Élise Pierre-Noël; sous la direction de Stéphane Bézieau
Publié : Nantes : Université de Nantes , 2021
Accès en ligne : Accès Nantes Université
Note sur l'URL : Accès réservé aux étudiants et personnels de l'Université de Nantes après authentification
Note de thèse : Reproduction de : Thèse d'exercice : Médecine. Génétique médicale : Nantes : 2021
Disponibilité : Accès réservé aux étudiants et personnels de l'Université de Nantes
Sujets :
Documents associés : Reproduction de: Étude des variants d'épissage dans le cadre des prédispositions aux cancers du sein et de l'ovaire
Description
Résumé : Le séquençage haut-débit a permis d'améliorer le diagnostic génétique des prédispositions génétiques aux cancers du sein et de l'ovaire. Cependant, il a aussi conduit à la détection d'une proportion importante de variants de signification inconnue. Parmi ces variants, les variants d'épissage pourraient représenter près d'un tiers des variants potentiellement délétères. Leur caractérisation repose sur l'étude des transcrits extraits des leucocytes circulants. Cette analyse nécessite une prise en charge préanalytique rigoureuse, afin de limiter les modifications du profil transcriptomique et la dégradation in vitro des transcrits, notamment par des mécanismes de contrôle-qualité des transcrits comme le système NMD. L'objectif de ce travail était de comparer les résultats obtenus à partir de deux méthodes préanalytiques : le prélèvement PAXgene RNA Blood et la culture cellulaire lymphocytaire avec et sans inhibiteur du NMD.
Notes : Description d'après la consultation, 2021-11-25
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Autre(s) contribution(s) : Marc Denis (Président du jury) ; Capucine Delnatte, Jean-Marc Classe (Membre(s) du jury)
Configuration requise : Un logiciel capable de lire un fichier au format PDF
Bibliographie : Bibliogr. 120 réf.