Développement d'outils de médecine de précision pour accompagner la prise de décision médicale en transplantation
La médecine de précision redéfinit le système de soins en proposant une adaptation systématique à chaque individu. A l aide de données en population, cette forme de médecine a pour objectif d optimiser les soins médicaux d un individu, par exemple en accompagnant les soignants dans la prise de décis...
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Collectivités auteurs : | , , |
Format : | Thèse ou mémoire |
Langue : | français |
Titre complet : | Développement d'outils de médecine de précision pour accompagner la prise de décision médicale en transplantation / Estelle Geffard; sous la direction de Pierre-Antoine Gourraud |
Publié : |
2020 |
Accès en ligne : |
Accès Nantes Université
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Note sur l'URL : | Accès au texte intégral |
Note de thèse : | Thèse de doctorat : Biologie, médecine et santé : Nantes : 2020 |
Sujets : |
Résumé : | La médecine de précision redéfinit le système de soins en proposant une adaptation systématique à chaque individu. A l aide de données en population, cette forme de médecine a pour objectif d optimiser les soins médicaux d un individu, par exemple en accompagnant les soignants dans la prise de décision grâce à des applications informatiques. Ce travail s articule autour de 2 applications de médecine de précision pour la transplantation permettant d améliorer la prise en charge des patients. Premièrement, la construction de la suite web Easy-HLA permet de simplifier l analyse des génotypes HLA, molécules essentielles de la réponse immunitaire. Le coeur des algorithmes d Easy-HLA est une base de données de plus de 600 000 haplotypes HLA et leurs fréquences. Deuxièmement, la création de l application KiTapp aide à améliorer le suivi des patients après une transplantation rénale. KiTapp est pensé comme un outil d aide à la décision pour les cliniciens. Cet outil se base sur l exploitation des données de la DIVAT à l aide d'algorithmes de contextualisation et cristallise la notion de POI/POR. Easy-HLA et KiTapp permettent de représenter, comparer et analyser systématiquement une information individuelle dans le contexte d une population analogue. La médecine de demain tend vers une médecine de précision basée sur l analyse en temps réel de données multiparamétriques avec pour point de départ le patient, en s appuyant sur des outils informatiques devenus incontournables. Precision medicine can be defined as a system of care adapted to an individual using population-based data. The aim of this new medicine s approach is to optimize an individual's medical care by supporting clinicians in their decision-making process using digital applications for example. This work focuses on 2 applications of precision medicine for transplantation to improve patient care. In this context, we built the Easy-HLA web suite to simplify the analysis of HLA genotypes, essential molecules of the immune response. The core of Easy-HLA's algorithms is a database of more than 600,000 HLA haplotypes and their frequencies. We also created KiTapp, an application that improves patient follow-up after kidney transplantation. KiTapp is designed as a decision support tool for clinicians. This tool exploits data from the DIVAT cohort using contextualization algorithms. Easy-HLA and KiTapp allow the systematic representation, comparison and analysis of individual information compared to a similar population. Tomorrow's medicine is moving towards a precision medicine based on realtime analysis of multiparametric data with the patient as the starting point while relying on computational tools that have become essential nowadays. |
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Variantes de titre : | Development of precision medicine tools to support medical decision making in transplantation |
Notes : | Titre provenant de l'écran-titre Ecole(s) Doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Rennes) Partenaire(s) de recherche : Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (Laboratoire) Autre(s) contribution(s) : Gilles Blancho (Président du jury) ; Jean-Luc Taupin, Alexandre Loupy, Diana Carolina Mateus Lamus (Membre(s) du jury) ; Jean-Luc Taupin, Sophie Caillard (Rapporteur(s)) |
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