Émergence de la résistance aux fluoroquinolones in vitro chez Cutibacterium acnes et caractérisation moléculaire des mutations retrouvées dans le gène gyrA

Les infections sur matériel documentées à Cutibacterium acnes sont souvent traitées par une association fluoroquinolones et rifampicine. Des CMI de 0,25mg/L à la lévofloxacine (LVX) sont observées mais la résistance n'a pas encore été investiguée. L'objectif de ce travail était donc d'...

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Auteurs principaux : Takoudju Eve-Marie (Auteur), Corvec Stéphane (Directeur de thèse)
Collectivités auteurs : Université de Nantes 1962-2021 (Organisme de soutenance), Nantes Université Pôle Santé UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques Nantes (Organisme de soutenance)
Format : Thèse ou mémoire
Langue : français
Titre complet : Émergence de la résistance aux fluoroquinolones in vitro chez Cutibacterium acnes et caractérisation moléculaire des mutations retrouvées dans le gène gyrA / Eve-Marie Takoudju; sous la direction de stéphane Corvec
Publié : Nantes : Université de Nantes , 2018
Accès en ligne : Accès Nantes Université
Note de thèse : Reproduction de : Thèse d'exercice : Pharmacie : Nantes : 2017
Reproduction de : Mémoire du D.E.S. : Biologie Médicale : Nantes : 2017
Conditions d'accès : Version électronique sous embargo jusqu'au 31-03-2018.
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Description
Résumé : Les infections sur matériel documentées à Cutibacterium acnes sont souvent traitées par une association fluoroquinolones et rifampicine. Des CMI de 0,25mg/L à la lévofloxacine (LVX) sont observées mais la résistance n'a pas encore été investiguée. L'objectif de ce travail était donc d'étudier l'émergence in vitro de la résistance à la lévofloxacine avec la caractérisation des mutations impliquées dans les gènes gyrA et parC, ainsi que la recherche d'éventuels systèmes d'efflux actif. La souche de C. acnes ATCC 11827 (CMI LVX = 0,25 mg/L) a été utilisée pour ces investigations. La fréquence de mutation a été déterminée après inoculation de 108 C. acnes sur des géloses au sang contenant des concentrations de LVX de 1 à 128 fois la CMI, incubées 7 jours en anaérobiose à 37°C. L'émergence d'un haut niveau de résistance a aussi été étudiée à partir des mutants de bas niveau après une seconde exposition. Les gènes gyrA et parC ont été séquencés et comparés à la séquence de référence de C. acnes. La présence d'un efflux a été étudié avec trois inhibiteurs d'efflux. La fréquence de mutation était respectivement de 1,6 x 10-7 (4xCMI) et 3,8 x 10-8 (8.CMI). Une résistance de bas ou de haut niveau à la LVX était observée. 89 mutants ont été étudiés dont 40 avec une mutation dans le gène gyrA. 10 génotypes différents ont pu être mis en évidence G99 C (n=4), G99 D (n=3), D100N (n=1), S101 L (n=14), S101W (n=5), D100 H (n=1), D100 G (n=1), A102 P (n=5), D105 H (n=4), D105 G (n=2). Aucune mutation n'a été trouvée dans le gène parC. Un éventuel mécanisme d'efflux a été mis en évidence par l'utilisation de PabN
Notes : Description d'après la consultation, 2018-04-20
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Bibliographie : Bibliogr. 150 réf.