Structure et interactions moléculaires d agonistes et de modulateurs allostériques des récepteurs nicotiniques de l acétylcholine
La découverte de l acétylcholine binding protein (AChBP) a permis des avancées majeures dans la caractérisation des récepteurs nicotiniques de l acétylcholine (nAChRs). Dans le cadre de ce travail, une approche combinant la mise en oeuvre de méthodes expérimentales et de calculs quantiques issus de...
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Format : | Thèse ou mémoire |
Langue : | français |
Titre complet : | Structure et interactions moléculaires d agonistes et de modulateurs allostériques des récepteurs nicotiniques de l acétylcholine / Alexandre Atkinson; sous la direction de Jean-Yves Le Questel et Jérôme Graton |
Publié : |
[S.l.] :
[s.n.]
, 2012 |
Description matérielle : | 1 vol. (203 p.) |
Note de thèse : | Thèse de doctorat : Chimie, Chimie physique : Nantes : 2012 |
Disponibilité : | Publication autorisée par le jury |
Sujets : | |
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Structure et interactions moléculaires d agonistes et de modulateurs allostériques des récepteurs nicotiniques de l acétylcholine |
Résumé : | La découverte de l acétylcholine binding protein (AChBP) a permis des avancées majeures dans la caractérisation des récepteurs nicotiniques de l acétylcholine (nAChRs). Dans le cadre de ce travail, une approche combinant la mise en oeuvre de méthodes expérimentales et de calculs quantiques issus de la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) a été utilisée pour (i) déterminer les conformations de basse énergie et les interactions d une série de ligands des nAChRs (l ACh, la nicotine, l épibatidine, la galanthamine et la codéine) (ii) mettre à jour un motif structural de l AChBP jouant un rôle majeur dans l interaction avec les agonistes (iii) étudier la complexation de trois ligands avec un modèle tridimensionnel du site de fixation par une méthode mixte QM/QM . Ainsi, malgré l importante similitude structurale de la galanthamine et de la codéine, la confrontation des résultats obtenus au cours de ce travail révèle des différences d interactions par liaison H significatives entre les deux composés. Par ailleurs, le motif structural mis à jour, qui comprend le Trp 143, impliqué dans la fixation des agonistes, et l Asp 85, hautement conservé dans la famille des canaux ioniques, a été caractérisé de façon approfondie, l influence d un effet coopératif sur le réseau de liaison H formé étant démontrée. Enfin, l ordre énergétique d interaction ACh |
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Variantes de titre : | Structure and molecular interactions of agonists and allosteric modulators of nicotinic acetylcholine receptors |
Bibliographie : | Réf. bibliogr. |