NantilusComparaison du typage moléculaire par M.L.V.A. et M.L.S.T. d'une collection de 70 isolats de E. coli au C.H.U. de Nantes
Le M.L.V.A. est une nouvelle technique de typage moléculaire innovante basée sur l analyse de plusieurs loci présentant des séquences répétées. Le but de cette étude était de développer une approche de typage par M.L.V.A. sur une cohorte de souches de E. coli préalablement caractérisées par M.L.S.T....
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| Format : | Thèse ou mémoire |
| Langue : | français |
| Titre complet : | Comparaison du typage moléculaire par M.L.V.A. et M.L.S.T. d'une collection de 70 isolats de E. coli au C.H.U. de Nantes / Axelle Paquin; sous la direction de Stéphane Corvec |
| Publié : |
[S.l.] :
[s.n.]
, 2010 |
| Description matérielle : | 1 vol. (92 f.) |
| Note de thèse : | Mémoire du D.E.S. : Biologie médicale : Nantes : 2010 Thèse d'exercice : Pharmacie : Nantes : 2010 |
| Sujets : | |
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Comparaison du typage moléculaire par M.L.V.A. et M.L.S.T. d'une collection de 70 isolats de E. coli au C.H.U. de Nantes |
| Résumé : | Le M.L.V.A. est une nouvelle technique de typage moléculaire innovante basée sur l analyse de plusieurs loci présentant des séquences répétées. Le but de cette étude était de développer une approche de typage par M.L.V.A. sur une cohorte de souches de E. coli préalablement caractérisées par M.L.S.T. Soixante-neuf souches d'origine humaine ou animale et un témoin ont été analysés. La technique développée par Lindsted et al. a été adaptée. Une typicité de 100 % et un polymorphisme des loci (index de diversité : de 0,03 à 0,91) étaient mis en évidence. Trente-cinq profils M.L.V.A. ont été retrouvés et 54 % des souches présentaient un profil qui ne variait que pour l'allèle 14. Les souches exprimant un mécanisme de résistance chromosomique (ST23, ST155) présentaient une homologie des profils où seul l allèle 14 variait. A l'inverse, les souches sauvages ou possédant un mécanisme de résistance plasmidique (BLSE ou AmpC plasmidique) présentaient des profils plus hétérogènes tant en M.L.V.A. qu'en M.L.S.T. Cette technique simple et rapide semble être plus discriminante que le M.L.S.T., pour des souches de même ST présentant des profils M.L.V.A. différents. Des études complémentaires devraient comparer ces performances à celles de l'E.C.P. lors d'épidémies ou pour analyser la circulation de certaines souches. |
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| Bibliographie : | Bibliogr. f. 85-92 [92 réf.] |